El Archivo Central del Rectorado custodia unas 15.000 cajas de documentación en papel en dos depósitos de 354 m2 de capacidad y 2.200 metros lineales de estantería. El fondo (pdf) del Archivo Central del Rectorado está formado por los documentos generados por el Equipo de Gobierno y los Servicios Centrales de la Universidad de Zaragoza.

Completan el fondo, libros, un pequeño fondo fotográfico, relativo esencialmente a actos institucionales como apertura de curso, San Braulio, etc. y una colección de carteles editados por la Universidad.

El Archivo Central del Rectorado es depositario de las tesis doctorales leídas en la Universidad de Zaragoza y conserva en sus dependencias las tesis correspondientes al curso académico 1998-1999 hasta la actualidad. Este archivo fue también receptor de las tesis correspondientes a los cursos académicos 1993-1994 hasta 1997-1998 pero fueron transferidas a la Biblioteca General Universitaria.

El cuadro de clasificación de aplicación en el Archivo Central del Rectorado es de carácter orgánico-funcional. Está basado en el análisis por una parte de los órganos productores de la documentación, y, por otra, las funciones que son competencia de estos órganos, cuyo ejercicio se materializa en las series documentales, cada una de las cuales está constituida por tipos documentales. Es un cuadro abierto, con posibilidades de adaptarse al crecimiento o supresión de competencias de los Servicios Centrales de la Universidad.